交通部表示,台北市區鐵路地下化東延南港工程(南港專案),將現有南港貨場遷移至台北縣汐止市五堵,並於五堵至七堵間增建一軌,配合五堵貨場興建所增加之貨運量,以維持列車運輸順暢及安全,並將七堵火車站前、後站併為一站,整合為南下列車的始發站。
新七堵車站位於自治街地下道西側、東新街與光明路間,另東新街側亦設有售票設備,方便原前、後站地區居民購票,該車站提供基隆及七堵間短途區間列車的客運業務,亦為七堵地區帶來城際區間便捷的運輸系統。
為考量居民工作通勤需要,新七堵車站已於2007年1月底正式啟用,惟僅開放部分區域使用,後續尚有工程進行中,2009年3月1日,新七堵車站東出口(東新街側廣場)陸續開放啟用,為配合南港專案國家重大建設及回饋地方民意需求,增建停車空間及站前售票大廳、辦公室、里民活動中心等,今新七堵車站(含旅客服務廊道)特種建築物擬申請變更設計,但車站東出口處尚餘部分土地未完成撥用程序,其使用分區亦不符現況使用,遂進行這次都市計畫個案變更。